Il Ritratto di Federico da Montefeltro col figlio Guidobaldo è un dipinto, tempera su tavola, forse di Pedro Berruguete (ma è stato attribuito anche a Giusto di Gand od allo stesso Melozzo da Forlì), databile al 1475 circa e oggi conservato nella Galleria nazionale delle Marche a Urbino.
Il Gonfalone dello Spirito Santo è un dipinto a tempera su tela (156×104 cm) di Luca Signorelli, datato al 1494 e conservato nella Galleria nazionale delle Marche di Urbino. Esso è dipinto su due lati, che mostrano rispettivamente la Crocifissione e la Discesa dello Spirito Santo.
La Pala del Corpus Domini è un’opera di Giusto di Gand con predella di Paolo Uccello, conservata nella Galleria nazionale delle Marche a Urbino. La predella, (tempera su tavola, 43×351 cm totali) è datata al 14671468 e la tavola principale (olio su tavola, 331×335 cm) al 1472-1474.
Sant’Agostino tra i flagellanti è un dipinto a olio tela di seta (115×83 cm) di Pinturicchio, databile al 1500 e conservato nella Galleria nazionale dell’Umbria di Perugia.
Il Polittico di Sant’Antonio è un’opera, tecnica mista su tavola (338×230 cm), di Piero della Francesca, databile al 1460-1470 circa e conservata nella Galleria nazionale dell’Umbria di Perugia.
Il Polittico di Sant’Agostino è un dipinto a olio su tavola di Pietro Perugino, databile a due fasi, una dal 1502 al 1512 circa e una dal 1513 al 1523 circa, conservato nella maggior parte degli scomparti alla Galleria Nazionale dell’Umbria a Perugia.
La Pala di Monteripido è un’opera a olio su tavola (240×180 cm, dipinta su due lati) di Pietro Perugino, databile al 1502 e conservata nella Galleria Nazionale dell’Umbria a Perugia.
La Pala di Santa Maria dei Fossi è un dipinto a olio su tavola e tela (512×314 cm) di Pinturicchio, databile al 1496-1498 e conservato nella Galleria nazionale dell’Umbria di Perugia.
La Pala della Trasfigurazione è un dipinto a olio su tavola (290×185 cm) di Pietro Perugino, databile al 1517 e conservato nella Galleria nazionale dell’Umbria a Perugia.
La Madonna in trono col Bambino e angeli musicanti è una tempera su tavola (115×64 cm) di Gentile da Fabriano, conservata alla Galleria nazionale dell’Umbria di Perugia e databile al 1405-1410 circa.